MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015562	T	6	6	109739	109744	0 %	100 %	0 %	0 %	333909997
3003	NC_015562	T	6	6	109747	109752	0 %	100 %	0 %	0 %	333909997
3004	NC_015562	TG	3	6	109768	109773	0 %	50 %	50 %	0 %	333909997
3005	NC_015562	TCA	2	6	109856	109861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909997
3006	NC_015562	GTT	2	6	109936	109941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909997
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3011	NC_015562	T	6	6	110156	110161	0 %	100 %	0 %	0 %	333909997
3012	NC_015562	CTTT	2	8	110210	110217	0 %	75 %	0 %	25 %	333909997
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3015	NC_015562	T	6	6	110234	110239	0 %	100 %	0 %	0 %	333909997
3016	NC_015562	ATC	2	6	110251	110256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909997
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3019	NC_015562	ATCT	2	8	110359	110366	25 %	50 %	0 %	25 %	333909997
3020	NC_015562	TTCA	2	8	110374	110381	25 %	50 %	0 %	25 %	333909997
3021	NC_015562	TTG	2	6	110453	110458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909997
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3023	NC_015562	TA	3	6	110547	110552	50 %	50 %	0 %	0 %	333909997
3024	NC_015562	T	6	6	110599	110604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015562	ATTA	2	8	110610	110617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015562	AATT	2	8	110736	110743	50 %	50 %	0 %	0 %	333909998
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3030	NC_015562	CTTA	2	8	110824	110831	25 %	50 %	0 %	25 %	333909998
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3040	NC_015562	A	7	7	111281	111287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015562	GTT	2	6	111336	111341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015562	TTTAA	2	10	111367	111376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015562	A	7	7	111480	111486	100 %	0 %	0 %	0 %	333909999
3044	NC_015562	T	6	6	111532	111537	0 %	100 %	0 %	0 %	333909999
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3056	NC_015562	TA	3	6	111928	111933	50 %	50 %	0 %	0 %	333909999
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3093	NC_015562	CATCTT	2	12	113600	113611	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333910001
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3095	NC_015562	CAT	2	6	113642	113647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910001
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3097	NC_015562	TTTA	2	8	113724	113731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015562	TAA	2	6	113739	113744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015562	A	6	6	113743	113748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015562	TA	3	6	113750	113755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015562	ATA	2	6	113795	113800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015562	GGAA	2	8	113891	113898	50 %	0 %	50 %	0 %	333910002
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3106	NC_015562	A	7	7	114085	114091	100 %	0 %	0 %	0 %	333910002
3107	NC_015562	AAAG	2	8	114112	114119	75 %	0 %	25 %	0 %	333910002
3108	NC_015562	TA	3	6	114120	114125	50 %	50 %	0 %	0 %	333910002
3109	NC_015562	ATA	2	6	114191	114196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910002
3110	NC_015562	A	6	6	114226	114231	100 %	0 %	0 %	0 %	333910002
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3113	NC_015562	ATTA	2	8	114275	114282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015562	A	6	6	114285	114290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015562	AAAT	2	8	114300	114307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015562	A	6	6	114315	114320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015562	ATT	2	6	114334	114339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910003
3118	NC_015562	TCA	2	6	114402	114407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910003
3119	NC_015562	AAG	2	6	114408	114413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910003
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3121	NC_015562	T	6	6	114461	114466	0 %	100 %	0 %	0 %	333910003
3122	NC_015562	TTTG	2	8	114470	114477	0 %	75 %	25 %	0 %	333910003
3123	NC_015562	CAT	2	6	114497	114502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910003
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3125	NC_015562	CTT	2	6	114694	114699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910003
3126	NC_015562	AACTCC	2	12	114747	114758	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333910003
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3128	NC_015562	AT	4	8	114818	114825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3130	NC_015562	AAT	2	6	114878	114883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3144	NC_015562	TTA	3	9	115353	115361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_015562	CAA	2	6	118662	118667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3249	NC_015562	GGT	2	6	118696	118701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_015562	A	6	6	118710	118715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_015562	TA	3	6	118756	118761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_015562	AATT	2	8	118788	118795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_015562	TTC	2	6	118824	118829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910010
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3256	NC_015562	CA	3	6	118957	118962	50 %	0 %	0 %	50 %	333910010
3257	NC_015562	GA	3	6	119000	119005	50 %	0 %	50 %	0 %	333910010
3258	NC_015562	TAT	2	6	119008	119013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910010
3259	NC_015562	ATA	2	6	119018	119023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910010
3260	NC_015562	CAA	2	6	119031	119036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910010
3261	NC_015562	TCC	2	6	119039	119044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910010
3262	NC_015562	T	6	6	119046	119051	0 %	100 %	0 %	0 %	333910010
3263	NC_015562	AAT	2	6	119063	119068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_015562	AATTT	2	10	119074	119083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_015562	TCA	2	6	119090	119095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_015562	T	6	6	119106	119111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_015562	TGT	2	6	119113	119118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_015562	AGG	2	6	119122	119127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3276	NC_015562	AATT	2	8	119268	119275	50 %	50 %	0 %	0 %	333910011
3277	NC_015562	TATC	2	8	119288	119295	25 %	50 %	0 %	25 %	333910011
3278	NC_015562	TTA	2	6	119321	119326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910011
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3280	NC_015562	GATT	2	8	119383	119390	25 %	50 %	25 %	0 %	333910011
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3282	NC_015562	ATT	2	6	119594	119599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910011
3283	NC_015562	ACT	2	6	119609	119614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910011
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3292	NC_015562	A	6	6	119944	119949	100 %	0 %	0 %	0 %	333910011
3293	NC_015562	A	6	6	120012	120017	100 %	0 %	0 %	0 %	333910011
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3301	NC_015562	ACA	2	6	120207	120212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910011
3302	NC_015562	TATG	2	8	120241	120248	25 %	50 %	25 %	0 %	333910011
3303	NC_015562	GAAT	2	8	120280	120287	50 %	25 %	25 %	0 %	333910011
3304	NC_015562	GGA	2	6	120291	120296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3356	NC_015562	GTC	2	6	121968	121973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3358	NC_015562	A	6	6	122029	122034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3361	NC_015562	GTT	2	6	122088	122093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_015562	ATTT	2	8	122110	122117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_015562	AAC	2	6	122220	122225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3364	NC_015562	A	6	6	122242	122247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3365	NC_015562	TTA	2	6	122248	122253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3366	NC_015562	ATT	2	6	122256	122261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_015562	TTTAA	2	10	122269	122278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_015562	ATA	2	6	122287	122292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910014
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3372	NC_015562	GA	3	6	122432	122437	50 %	0 %	50 %	0 %	333910014
3373	NC_015562	AT	3	6	122462	122467	50 %	50 %	0 %	0 %	333910014
3374	NC_015562	A	6	6	122483	122488	100 %	0 %	0 %	0 %	333910014
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3377	NC_015562	GCA	2	6	122703	122708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910014
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3379	NC_015562	A	6	6	122727	122732	100 %	0 %	0 %	0 %	333910014
3380	NC_015562	TGA	2	6	122828	122833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910014
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